Course

Curs de Bionformàtica per a la Recerca Biomèdica

Date: 16/11/2020 09:00 - 16/12/2020 11:00

El curs està organitzat per la Unitat d'Estadística i Bioinformàtica (UEB) del Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR). El curs serà impartit pel cap de la UEB, el Dr. Álex Sánchez, doctor en Estadística, màster en Bioinformàtica i professor titular del departament de Genètica, Microbiologia i Estadística de la Universitat de Barcelona, i per membres de la UEB, el Dr. Ricardo Gonzalo, doctor en Biologia molecular i Màster en Bioinformàtica i Bioestadística, la Dra. Mireia Ferrer, doctora en Biomedicina i Màster en Bioestadística i Bioinformàtica, la Dra. Berta Miró, doctora en Biologia i Màster en Bioestadística i Bioinformàtica i Àngel Blanco, llicenciat en Biologia.

La recerca biomèdica moderna necessita sovint fer servir informació de diverses menes; per exemple sobre estructures, seqüències, anotacions o funcions de diferents tipus d'entitats i components biològics.

Course

SEGONA EDICIÓ POSTGRAU - CIÈNCIA DE LES DADES (DATA SCIENCE): APLICACIONS EN BIOLOGIA I EN MEDICINA AMB PYTHON I R (2019-2020)

Date: 12/03/2020 00:00 - 13/07/2020 00:00

·    Antonio Monleón Getino (Coordinación). Biost3, GRBIO. Sección Estadística. Dep GME-UB
·    Biel Stela Ballester. Bioinformático. Pharmacoinformatics Group. UPF
·    Alexandre Perera i Lluna. UPC
·    Pere Puigdomènech, HPCNow!
·    Pere López. Biost3, Sección Estadística. Dep GME-UB
·    Xavier de Pedro. Ajuntament de Barcelona.
·    Carlos Crespo. Biost3, Sección Estadística. Dep GME-UB
·    Andreu Paytuví. Bioinformático. Sequentia-Biotech
·    David Jorquera. Informático.
·    Cesc Múrria. Secció d'Ecologia, Departament de Biologia Evolutiva, Ecologia i Ciències Ambientals. Fac Biologia. UB
·    Santiago Marco, Departamento de Ingeniería Electrónica y Biomédica. Facultad de Física. UB
·    Petia Radeva. Dept. Mathematics and Computer Science. Facultad de Matemáticas e Informática. UB.
·    Frederic Bartumeus. CSIC
·    Isaac Subirana. IMIM. Sección Estadística. Dep GME-UB
·    Pau Fortuño. Secció d' Ecologia. Facultat de Biologia. UB

Data science is a multi-disciplinary field that uses scientific methods, processes, algorithms and systems to extract knowledge and insights from structured and unstructured data.

Workshop

Herramientas básicas de visualización de datos con R

Date: 10/07/2019 09:30 - 12/07/2019 13:30

Marta Coronado

Raquel Egea

En este taller práctico de 12 horas se aprenderá a utilizar el paquete de R ggplot2 para transformar datos biológicos en un mensaje claro y aprender a extraer información útil de ellos a través de gráficos avanzados.

Workshop

Introduction to deep learning in R (with examples in R)

Date: 22/07/2019 09:30 - 23/07/2019 13:30

Dr. Emanuele Raineri

In this workshop we will discuss basic concepts of deep learning and how to use R to run some simple but realistic examples.

Workshop

Introducción a Linux (2019)

Date: 08/07/2019 09:30 - 09/07/2019 13:30

Dr. Raquel Egea

Dr. Marta Coronado

Este taller de 8 horas combina teoría y prácticas con actividades y problemas para tener una primera toma de contacto con el funcionamiento y la gestión del sistema operativo Linux, aprendiendo a plantear y resolver las posibles cuestiones que puedan aparecer.

Workshop

Inferencia estadística con R (2019)

Date: 25/06/2019 09:30 - 27/06/2019 13:30

Dr. Antonio Barbadilla

En el taller se transmitirá una visión integrada del análisis estadístico, una que no se limita a calcular la probabilidad o significación de una prueba (el valor p), sino que incluya todas las etapas que van desde el diseño experimental inicial, el tratamiento correcto de los datos primarios hasta la interpretación de la significación de la prueba estadística (Leek & Peng 2015).

Workshop

Python moderno para científicos (2019)

Date: 15/07/2019 09:30 - 18/07/2019 13:30

Dr. Raquel Egea

Dr. Marta Coronado

Python se ha convertido en un lenguaje de referencia tanto para aprender a programar como para crear con rapidez y elegancia programas avanzados en multitud de campos.

Workshop

Protein-ligand Dockings. Conceptos y aplicaciones (2019)

Date: 01/07/2019 09:30 - 04/07/2019 13:30

Jean-Didier Maréchal

Bajo una aparente sencillez, los programas de Protein-ligand dockings esconden fundamentos matemáticos, químicos y biofísicos substanciales y sus análisis en el marco biológico y bioquímico puede fácilmente llevar a sobrevaloraciones o, al contrario, sobrecríticas.

Course

4th VPH Summer School

Date: 10/06/2019 09:00 - 14/06/2019 00:00

15 international speakers:

Blanca Rodríguez (University of Oxford)

Philippe Zysset (Institute of Surgical Technology and Biomechanics - University of Bern)

Daniel Rückert (Imperial College London)

Miguel Ángel González Ballester (Universitat Pompeu Fabra)​

Caitríona Lally ( Trinity College Dublin)

Georgia Sarquella-Brugada (Hospital Sant Joan de Deu, Spain)

Nathalie Virag (Medtronic)

Josep Maria Antó (ISGlobal)

Marko Vendelin (Institute of Cybernetics, Tallinn University of Technology)

Marino Arroyo (Universitat Politècnica de Catalunya)

Mark van Gils (VTT TECHNICAL RESEARCH CENTRE OF FINLAND LTD)

Frits Prinzen (University of Maastricht)

Merryn Tawhai (Auckland Bioengineering Institute)

Janine N Post (Dept. Developmental BioEngineering, MIRA institute for biomedical technology and technical medicine, University of Twente, Enschede, The Netherlands)

​Baldo Oliva (University Pompeu Fabra).

The VPH Summer School series is co-organized by the Universitat Pompeu Fabra and by the Virtual Physiological Human Institute (VPHi), and is further endorsed by different international Research societies, Networks of Excellence and Project consortia.

Course

Modelos del Deep Learning para el análisis de datos ómicos con Keras para R

Date: 09/09/2019 16:00 - 13/09/2019 20:00

Esteban Vegas y Ferran Reverter

Saber aplicar models bàsics de Deep Learning a partir d'una implementació basada en Keras per a l anàlisi de dades òmiques.  

Course

Análisis de datos y diseño de experimentos con R

Date: 03/07/2019 16:00 - 10/07/2019 20:00

Ferran Reverter i Francesc Carmona

Es tracta d'un curs intensiu que recull les principals tècniques de tractament de dades experimentals i la seva anàlisi estadística. L'avantatge és la utilització del llenguatge R.

Course

Gestión de datos, programación y gráficos con R

Date: 25/06/2019 16:00 - 02/07/2019 20:00

Esteban Vegas i Antonio Miñarro

Donar les eines bàsiques del llenguatge de programació R d'aplicació a l'Estadística de forma que l'alumnat pugui continuar el seu aprenentatge de forma autodidacta.

Workshop

BIOINFORMATICS WORKSHOP: OMICS & DATA SCIENCE REVOLUTION, A NEW ERA IN BIOLOGY?

Date: 04/06/2019 08:45 - 19:00

·   W. Sanseverino (Sequentia Biotech)
·   R. Aiese Cigliano (Sequentia Biotech)
·   T. Gabaldón (CRG)
·   C. Mùrria (UB)
·   J.Méndez. Servei de Fermentació. Microbiologia.
·   S.Marco, UB
·   A. Paytuvi (Sequentia Biotech)
·   Riccardo Aiese Cigliano (Sequentia Biotech)
·   A. Monleon- Getino (BIOST3-UB)

Bioinformatics workshop on data analysis : Next Generation Sequencing, amplicon, metagenomics, metatranscriptomics, RNAseq, metabarcoding, data science/statistics and omics data computing, metabolomics.

Course

CIÈNCIA DE LES DADES (DATA SCIENCE): APLICACIONS EN BIOLOGIA I EN MEDICINA AMB PYTHON I R

Date: 07/05/2019 00:00 - 16/07/2019 00:00

·    Antonio Monleón Getino (Coordinación). Biost3, GRBIO. Sección Estadística. Dep GME-UB
·    Biel Stela Ballester. Bioinformático. Pharmacoinformatics Group. UPF
·    Alexandre Perera i Lluna. UPC
·    Pere Puigdomènech, HPCNow!
·    Pere López. Biost3, Sección Estadística. Dep GME-UB
·    Xavier de Pedro. Ajuntament de Barcelona.
·    Carlos Crespo. Biost3, Sección Estadística. Dep GME-UB
·    Andreu Paytuví. Bioinformático. Sequentia-Biotech
·    David Jorquera. Informático.
·    Cesc Múrria. Secció d'Ecologia, Departament de Biologia Evolutiva, Ecologia i Ciències Ambientals. Fac Biologia. UB
·    Santiago Marco, Departamento de Ingeniería Electrónica y Biomédica. Facultad de Física. UB
·    Petia Radeva. Dept. Mathematics and Computer Science. Facultad de Matemáticas e Informática. UB.
·    Frederic Bartumeus. CSIC
·    Isaac Subirana. IMIM. Sección Estadística. Dep GME-UB
·    Pau Fortuño. Secció d' Ecologia. Facultat de Biologia. UB.

A causa del ràpid desenvolupament de la recerca biomèdica, els biocientífics han demostrat la necessitat d'adoptar conceptes i eines d'altres àrees, com són l'aprenentatge automàtic, la química computacional, l'enginyeria, la matemàtica, la física o la biodiversitat.

Course

Curs Ada Lovelace: dissenya el teu propi algoritme per desxifrar la informació que contenen les molècules

Date: 11/02/2019 09:00 - 14:00

El Dia Internacional de la Dona i la nena en Ciència és una jornada dedicada a la participació de les dones i les nenes en la ciència, la tecnologia, l'enginyeria i les matemàtiques (STEM) que té per objectiu visibilitzar i reconèixer les dones que treballen en l'àmbit científic, així com introduir noies joves dins d'aquesta dinàmica d'igualtat i dins el món de la ciència i la tecnologia.

Course

Curs de Bioinformàtica per a la Recerca Biomèdica

Date: 19/11/2018 09:00 - 03/12/2018 13:20

La recerca biomèdica moderna necessita sovint fer servir informació de diverses menes; per exemple sobre estructures, seqüències, anotacions o funcions de diferents tipus d'entitats i components biològics.

Course

Genética Aplicada a la Oncología de Precisión

Date: 28/09/2018 16:00 - 27/10/2018 15:15

Seminar

Update Directiu: "Medicina personalitzada: realitat i reptes"

Date: 28/11/2018 09:00 - 28/06/2018 15:00

Course

Protein-ligand Dockings. Conceptos y aplicaciones

Date: 09/07/2018 09:30 - 12/07/2018 13:30

Course

Python moderno para científicos

Date: 02/07/2018 09:30 - 06/07/2018 13:30

Course

Intro to statistical computing in Python

Date: 23/07/2018 09:30 - 24/07/2018 13:30

Course

Introducción a Linux

Date: 28/06/2018 09:30 - 29/06/2018 13:30

Course

Inferencia estadística con R

Date: 25/06/2018 09:30 - 27/06/2018 13:30

Course

Programación en Perl básico para bioinformáticos

Date: 16/07/2018 09:30 - 20/07/2018 13:30

Course

Análisis de datos y diseño de experimentos con R

Date: 03/07/2019 16:00 - 10/07/2019 20:00

Ferran Reverter y Francesc Carmona

Es tracta d'un curs intensiu que recull les principals tècniques de tractament de dades experimentals i la seva anàlisi estadística. L'avantatge és la utilització del llenguatge R.

Course

Gestión de datos, programación y gráficos con R

Date: 04/06/2018 16:00 - 11/06/2018 20:00

Course

Ramon Margalef Colloquia "Ecology through the omics lens"

Date: 08/07/2018 09:00 - 13/07/2018 17:00

Several speakers. The Colloquium will be structured in 4 sessions. Each session consist of a combination of lectures, and group discussion.

The Ramon Margalef Summer Colloquium (RMSC) has been running yearly since 2013 and aims at training young researchers in Ecology, as well as promoting their networking and debate with invited lecturers as well as among themselves.

Course

Data Science: applications to biology and medicine with Phyton and R

Date: 03/05/2018 08:00 - 31/07/2018 18:00

Course

Curs d'Estadística Bàsica per a la Investigació Biomèdica

Date: 05/03/2018 09:00 - 14/03/2018 14:00

La recerca biomèdica té una component quantitativa important i els investigadors necessiten sovint poder processar i analitzar les dades que recullen o generen en els seus estudis.

Course

Creación de Aplicaciones Shiny

Date: 13/02/2018 09:00 - 14/02/2018 18:00

Workshop

Systems Medicine for Personalized Cancer Therapies

Date: 12/01/2018 09:00 - 13:00

Workshop

Multi-scale study of 3D chromatin structure - 2nd edition

Date: 13/12/2017 09:00 - 14/12/2017 18:00

• Modesto Orozco, Ricard Illa, Federica Battistini, Jürgen Walther (IRB Barcelona)
• David Castillo, François Serra (CNAG-CRG)
• Brian Jiménez (Barcelona Supercomputing Center) 

This workshop will introduce delegates to a Virtual Research Environment (VRE), created by the Multi-scale complex Genomics project (MuG), to facilitate the analysis and interpretation of the 3D and 4D structure of the genome.

Course

Curs de Bioinformàtica per a la Recerca Biomèdica

Date: 20/11/2017 11:17 - 29/11/2017 11:17

La recerca biomèdica moderna necessita sovint fer servir informació de diverses menes; per exemple sobre estructures, seqüències, anotacions o funcions de diferents tipus d'entitats i components biològics.

Course

Curs d'Estadística Avançada per a la Investigació Biomèdica

Date: 06/11/2017 11:37 - 15/11/2017 11:37

La recerca biomèdica té una component quantitativa important i els investigadors necessiten sovint poder processar i analitzar les dades que recullen o generen en els seus estudis.

Seminar

Mass spectrometry and metabolomics data analysis for synthetic biology

Date: 14/07/2017 10:00 - 11:00

Maria Vinaixa, Synthetic Biology for Fine and Speciality Chemicals (SYNBIOCHEM), Manchester Institute of Biotechnology.

Maria Vinaixa from the Manchester Institute of Biotechnology will be talking about her work on metabolomics data analysis pipelines to better understand fundamental biological processes.

Course

Bioinformatics Bootcamp for Engineers

Date: 18/09/2017 09:00 - 19/09/2017 18:00

Why a course on bioinformatics for engineers? Bioinformatics is by definition an interdisciplinary field, but transitioning from an engineering background into bioinformatics requires more than a mere introduction to biology.

Workshop

Workshop sobre Bioinformàtica per a enginyers

Date: 11/07/2017 17:30 - 19:30

L'11 de juliol el COEIC acollirà un workshop gratuït organitzat per l'Associació Bioinformatics Barcelona (BIB) i el Col·legi d'Enginyers en Informàtica de Catalunya (COEINF), en representació d'Enginyers de Catalunya (*), amb l'objectiu d'informar totes aquelles persones amb inquietuds sobre la bioinformàtica i propiciar l'interès en vers aquesta disciplina des de l'àmbit de l'enginyeria.

Seminar

Human data management in the pan-European ELIXIR context: the Finland angle

Date: 18/05/2017 12:00 - 13:03

Juha Törnroos - CSC - IT Center for Science Ltd. / ELIXIR Finland

Support human data management at each step of the research project life cycle is one of the key objectives of ELIXIR Finland. To fulfill scientific community's needs ELIXIR Finland focus is on building solutions for storing and accessing human data at the most secure manner.

Course

Curso sobre Bioherramientas en Bioestadística y Bioinformática (1a ed.)

Date: 16/05/2017 09:00 - 18/05/2017 18:00

Workshop

ELIXIR Text-mining Workshop / Biocreative & BeCalm Workshop

Date: 25/04/2017 11:00 - 27/04/2017 18:30

Co-located text-mining workshops Advances in high-throughput technology have resulted in tremendous growth of biological data, and the number of research papers published continues to increase.

Workshop

Workshop tecnològic: Integració de dades òmiques

Date: 03/03/2017 10:00 - 14:00

Workshop

1st BGSMath Data Science Workshop

Date: 22/02/2017 09:00 - 18:00

Joan del Castillo
Ricard Gavaldà
Jordi Vitrià
Piotr Zwiernik
Cetric Notredame
Daniel Villatoro

The workshop aims to bring together the internal practitioners in the area across the Barcelona Graduate School of Mathematics, as well as those working in related fields and/or other local organizations, to discuss ongoing research and strengthen the links of a growing network.

Seminar

On crowdsourcing, cancer genomics and liquid biopsies

Date: 08/02/2017 16:00 - 17:00

Gustavo Stolovitzky, PhD (IBM Research / Icahn School of Medicine, Mount Sinai, New York, US)

Course

Filogenias y Genealogías de DNA: Reconstrucción y Aplicaciones (15a edición)

Date: 04/07/2017 10:00 - 14/07/2017 14:00

Course

Curs de Bioinformàtica per a la Recerca Biomèdica (2a ed. 2016)

Date: 12/12/2016 09:00 - 21/12/2016 14:00

La recerca biomèdica moderna necessita sovint fer servir informació de diverses menes; per exemple sobre estructures, seqüències, anotacions o funcions de diferents tipus d'entitats i components biològics.

Seminar

Bioinformatics for 100.000 Genomes

Date: 02/11/2016 15:30 - 17:00

Augusto Rendon PhD

Course

Curs de Bioinformàtica per a la Recerca Biomèdica

Date: 02/11/2016 09:00 - 14/11/2016 14:00

La recerca biomèdica moderna necessita sovint fer servir informació de diverses menes; per exemple sobre estructures, seqüències, anotacions o funcions de diferents tipus d'entitats i components biològics.

Course

Bioinformatics Bootcamp for Biomedical Practitioners

Date: 08/09/2016 08:00 - 09/09/2016 18:30

Seminar

The Perseus computational platform for comprehensive analysis of (prote)omics data

Date: 01/07/2016 12:00 - 13:00

Course

Estadística Avançada per a la Investigació Biomèdica

Date: 04/07/2016 09:00 - 13/07/2016 14:00

La recerca biomèdica té una component quantitativa important i els investigadors necessiten sovint poder processar i analitzar les dades que recullen o generen en els seus estudis.

Seminar

Systems medicine and proactive P4 medicine: Transforming healthcare through wellness

Date: 28/04/2016 12:00 - 13:00

Leroy Hood
Institute for Systems Biology. Seattle, USA

Seminar

Big Data Analytics in Metagenomics

Date: 06/07/2015 15:00 - 16:00

Prof. Saman K. Halgamuge
Department of Mechanical Engineering and Biomedical Engineering Program
Melbourne School of Engineering, University of Melbourne, Australia

Course

Curs de Bioinformàtica per a la Recerca Biomèdica

Date: 09/12/2015 09:00 - 18/11/2015 14:00